Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PctpP53808 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PctpP53808 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PctpP53808 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms