Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tssk4-203ENSMUST00000226497 1235 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms