Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms