Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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PtprmP28828 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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