Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
H2-Eb1P04230 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms