Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm5483B2RV77 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm5483B2RV77 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms