Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms