Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms