Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm22649-201ENSMUST00000175134 298 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Nop56Q9D6Z1 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 5730435O14Rik-202ENSMUST00000170047 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms