Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms