Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp11Q99K46 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp11Q99K46 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp11Q99K46 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp11Q99K46 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp11Q99K46 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp11Q99K46 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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