Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Setd1bQ8CFT2 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Setd1bQ8CFT2 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Setd1bQ8CFT2 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Setd1bQ8CFT2 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Setd1bQ8CFT2 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Setd1bQ8CFT2 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Setd1bQ8CFT2 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Setd1bQ8CFT2 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms