Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Snx8Q8CFD4 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms