Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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