Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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