Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ccdc88cQ6VGS5 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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