Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms