Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm37978-201ENSMUST00000194736 2915 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Samd11Q1RNF8 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms