Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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