Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
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Rpusd2Q149F1 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Rpusd2Q149F1 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 4921517D22Rik-201ENSMUST00000061597 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Hrh1-204ENSMUST00000161220 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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