Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms