Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 n-R5s51-201ENSMUST00000104473 123 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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Msx2Q03358 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Msx2Q03358 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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Msx2Q03358 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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Msx2Q03358 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Msx2Q03358 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Msx2Q03358 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Msx2Q03358 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Msx2Q03358 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Msx2Q03358 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Msx2Q03358 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Msx2Q03358 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Msx2Q03358 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
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