Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms