Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Sh3bp1P55194 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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Sh3bp1P55194 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Sh3bp1P55194 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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Sh3bp1P55194 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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