Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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Hoxc13P50207 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxc13P50207 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxc13P50207 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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