Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chd1P40201 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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