Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprkP35822 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprkP35822 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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