Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp4P35123 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp4P35123 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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