Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms