Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms