Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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PtprmP28828 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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PtprmP28828 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
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