Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Prim1P20664 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Prim1P20664 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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Prim1P20664 Gm3822-201ENSMUST00000201941 2935 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm10286-201ENSMUST00000093603 5077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Ap3b1-201ENSMUST00000022196 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Prim1P20664 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Prim1P20664 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Prim1P20664 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Prim1P20664 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Prim1P20664 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Prim1P20664 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm43219-201ENSMUST00000197972 1937 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Foxp3-204ENSMUST00000115740 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 AI182371-206ENSMUST00000226631 1680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm18289-201ENSMUST00000203356 2989 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Zfp819-201ENSMUST00000032661 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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