Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms