Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
P10404 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
P10404 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms