Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
P04214 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P04214 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P04214 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms