Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Ccl20O89093 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Ccl20O89093 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Ccl20O89093 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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