Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Spocd1B1ASB6 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms