Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms