Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Cnga3Q9JJZ8 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnga3Q9JJZ8 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Cnga3Q9JJZ8 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms