Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC123665.5-201ENSMUST00000226648 1392 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 2310040G07Rik-201ENSMUST00000101090 478 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm12875-201ENSMUST00000118745 344 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm12864-201ENSMUST00000122207 1006 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Chn1os1-201ENSMUST00000123613 636 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr960-203ENSMUST00000216584 1148 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm6989-201ENSMUST00000218409 654 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms