Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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OtofQ9ESF1 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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OtofQ9ESF1 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
OtofQ9ESF1 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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