Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm8948-201ENSMUST00000216371 370 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pfdn1Q9CWM4 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Pfdn1Q9CWM4 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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