Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 B130021K23Rik-201ENSMUST00000205226 2593 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gja10-202ENSMUST00000219644 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Elp3-203ENSMUST00000225355 2771 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm12864-201ENSMUST00000122207 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm4850-201ENSMUST00000185684 559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Nudt13-201ENSMUST00000022343 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Olfr545-202ENSMUST00000216116 3496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Napg-201ENSMUST00000025474 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rsph6aQ8CDR2 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms