Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NischQ80TM9 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NischQ80TM9 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms