Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms