Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trafd1Q3UDK1 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms