Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf3-202ENSMUST00000130216 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34280-201ENSMUST00000208250 2114 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Pvt1-201ENSMUST00000180432 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Numb-204ENSMUST00000117217 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4283 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28321-201ENSMUST00000187677 2327 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt7-201ENSMUST00000034021 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 AC115744.1-201ENSMUST00000222398 2379 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25613-201ENSMUST00000104012 129 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24349-201ENSMUST00000158709 101 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2564-201ENSMUST00000166898 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv4-62-201ENSMUST00000177795 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2404-201ENSMUST00000196197 844 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ldhc-205ENSMUST00000211784 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ubash3b-206ENSMUST00000151485 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Xpnpep2-203ENSMUST00000115000 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Ralgps2-201ENSMUST00000027886 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem106a-202ENSMUST00000100403 2428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc49-210ENSMUST00000166168 2784 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb2-201ENSMUST00000050406 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7353-201ENSMUST00000069044 2866 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr412-202ENSMUST00000216362 1786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc25b-202ENSMUST00000079857 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43847-201ENSMUST00000200070 1940 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Sars-201ENSMUST00000090553 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r56-201ENSMUST00000163852 2340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 4933431E20Rik-210ENSMUST00000152663 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Rab6a-203ENSMUST00000107048 2617 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp18-202ENSMUST00000109996 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gngt2-203ENSMUST00000107708 629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gtpbp6Q3U6U5 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms