Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms