Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Top2aQ01320 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms