Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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